Sustav za gel-elektroforezu u pulsirajućem polju (PFGE) (Šestar ID: 3711)
- Opći podaci o instrumentu
Skraćeni naziv instrumenta
PFGE sustav
Inventarni broj
S08270
Opći opis
Naizmjenično električno polje između prostorno različitih parova elektroda uzrokuje da se DNA veličine megabaze (Mb) ponovno orijentiraju i kreću različitim brzinama kroz pore u agaroznom gelu. Napon se povremeno mijenja između tri smjera; jedan koji prolazi kroz središnju os gela i dva koji se protežu pod kutom od 60 stupnjeva s obje strane. Vremena impulsa su jednaka za svaki smjer što rezultira neto migracijom DNK prema naprijed. Za iznimno velike molekule mogu se koristiti rampe intervala prebacivanja koje povećavaju vrijeme impulsa za svaki smjer tijekom određenog broja sati. Sustav CHEF Mapper odvaja velike i male fragmente DNA boljom rezolucijom, brzinom i točnošću od tradicionalnih metoda pulsiranja polja. Metodom se učinkovito razdvajaju DNA veličine u rasponu od 100 pb do preko 10 Mb.
Uža područja primjene
Mikrobiologija, molekularna biologija, genetika, istraživanje tumora, javno zdravstvo
Namjena instrumenta
Sustav za gel-elektroforezu u pulsirajućem polju (PFGE) je tehnika razdvajanja DNA molekula veličine do cca. 10 Mb njihovom preorijentacijom i kretanjem različitim brzinama kroz pore agaroznog gela. PFGE se koristi za genotipizaciju ili utvrđivanje genets
Tijelo koje je financiralo nabavku opreme
Europska komisija
Naziv projekta u sklopu kojeg je instrument nabavljen
Funkcionalna integracija Sveučilišta u Splitu, PMF-ST, PF-ST te KTF-ST kroz razvoj znanstveno-istraživačke infrastrukture u Zgradi tri fakulteta (KK.01.1.1.02.0018)
Kategorija
srednja
Vrsta instrumenta
sustav/uređaj za elektroforezu
Vrsta analize
biološka/DNA analiza, fragmentacija DNA, analiza DNK, mikrobiološka analiza, gel elektroforeza
Primjene
analiza ekspresije gena, analiza DNA, elektroforeza DNA
Ključne riječi
DNA analiza, genotipizacija
Samostalan/Vezan
Samostalan instrument
Trenutno stanje instrumenta
Potpuno funkcionalan
Procijenjeni broj korisnika
5
Godina proizvodnje
2020
- Ustanova i lokacija
Ustanova
Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet
Ruđera Boškovića 33, SplitZavod
Odjel za biologiju
Laboratorij
Laboratorij za mikrobiologiju
Grad
Split
Ulica i broj
Ruđera Boškovića 33
Krilo/Kat/Soba
2. kat/B2-64
- Uvjeti korištenja
Način korištenja instrumenta
samostalni rad - ovlašteni korisnici, znanstvena suradnja
Servis uz naplatu
priprema i obrada uzorka, analiza uzorka, interpretacija dobivenih rezultata, prema raspoloživom cjeniku
Znanstvena suradnja
moguće korištenje uz pomoć kvalificirane/zadužene osobe
Je li instrument prenosiv
ne
Je li moguće korištenje instrumenta na daljinu (remote)
ne
- Voditelj instrumenta (Kontakt osoba I)
Ime i prezime
Ana Maravić
Titula
Izv.prof.dr.sc.
E-mail
ana.maravic@pmfst.hr
Telefon
+385 21 619 281
- Karakteristike
Model
CHEF Mapper XA Chiller System
Mrežna (URL) adresa instrumenta na stranicama proizvođača
https://www.bio-rad.com/en-hr/product/chef-mapper-xa-system?ID=9153c7d0-407e-433e-8411-056120984257
Princip rada i mjerna tehnika
Naizmjenično električno polje između prostorno različitih parova elektroda uzrokuje da se DNA veličine megabaze (Mb) ponovno orijentiraju i kreću različitim brzinama kroz pore u agaroznom gelu. Napon se povremeno mijenja između tri smjera; jedan koji prolazi kroz središnju os gela i dva koji se protežu pod kutom od 60 stupnjeva s obje strane. Vremena impulsa su jednaka za svaki smjer što rezultira neto migracijom DNK prema naprijed. Za iznimno velike molekule mogu se koristiti rampe intervala prebacivanja koje povećavaju vrijeme impulsa za svaki smjer tijekom određenog broja sati. Sustav CHEF Mapper odvaja velike i male fragmente DNA boljom rezolucijom, brzinom i točnošću od tradicionalnih metoda pulsiranja polja. Metodom se učinkovito razdvajaju DNA veličine u rasponu od 100 pb do preko 10 Mb.
Proizvođač
Bio-Rad, SAD
Mrežna (URL) adresa proizvođača
https://www.bio-rad.com/
Nabavna cijena
527.333
Ostale tehničke karakteristike
• Sustav koristi CHEF, PACE, DR, FIGE i AFIGE tehnologiju.
• Mogućnost razdvajanja fragmenata od min. 100bp do 10Mb.
• Ugrađeno napajanje od 350 V max., gradijent od 9 V/cm te kontinuirano namještanje.
• Baterijska potpora radne memorije kako bi se u slučaju nestanka struje omogućilo pamćenje svih zadanih parametara i napretka izvršavanja protokola
• Mogućnost odgođenog starta od barem 72 sata.
• Elektrodni potencijal sustava dinamički reguliran +/- 0.5% F.S.
• Raspon prebacivanja (switching) od min. 50 ms do >10 sati.
• Promjenjiv kut prebacivanja od 0 do 360° potpuno elektronski uz promjenu u koracima od 0,5°.
• Do 15 vektora prebacivanja po ciklusu definiranih, prema kutu, voltaži i trajanju.
• Sekundarni puls određen prema voltaži, frekvenciji, kutu i vremenu.
• Mogućnost rada sa 8 programskih blokova sa automatskim izvršavanjem.
• Maksimalno vrijeme vožnje od 999 sati po bloku.
• Jedinica za elektroforezu od 24 elektrode od platine.
Mrežna (URL) adresa s tehničkim karakteristikama
https://www.bio-rad.com/en-hr/product/chef-mapper-xa-system?ID=9153c7d0-407e-433e-8411-056120984257
- Slike
- Dokumenti