Sustav se sastoji od glavne jedinice u kojoj se nalazi pećnica sa odgovarajućom kolonom, autosamplera sa 150 radnih mjesta za automatsko injektiranje te masenog selektivnog detektora (MS) koji uključuje ionski izvor s elektronskim snopom. Sustav je spojen sa izvorom plina helija. Upravljanje cijelim sustavom vrši se pomoću računala putem specijalnog softwera Mass Hunter.
Uža područja primjene
GC/MS uređaj se koristi za odjeljivanje, identifikaciju i kvantifikaciju organskih spojeva čija se prisutnost može zabilježiti primjenom masenog selektivnog detektora. Trenutno se primjenjuje za određivanje tvari arome voća, vina i eteričnih ulja.